La Dirección Municipal de Higiene y Epidemiología de Ciénaga de Zapata, tiene la misión de planificar, organizar, dirigir y controlar las acciones de lucha antiepidémica incluída la inspección sanitaria estatal y la vigilancia epidemiológica. Participa en las investigaciones epidemiológicas que estén orientadas al conocimiento de las enfermedades transmisibles y no transmisibles y su modificación.